当层高不够时，可以采取以下几种方式补偿：
首先，可以尝试与开发商协商，要求其按照实际损失进行赔偿。双方可以就赔偿金额进行谈判，并签订书面协议。
如果协商不成，可以通过相关部门或专业机构对房屋的实际价值与约定层高价值的差额进行评估，确定赔偿金额。
如果协商和评估都无法解决问题，可以向房屋所在地的住房城乡建设部门投诉，或者通过法律途径维护自身权益。法院会根据具体情况，结合层高差、房屋面积、房屋销售单价等因素，酌情确定赔偿金额。
如果房屋买卖合同中已经明确规定了房屋层高，而实际层高不够，则构成违约，开发商应当承担违约责任。赔偿方式可以包括修理、重作、更换、退货、减少价款或报酬等，具体方式应根据合同约定和法律规定确定。
根据《最高人民法院关于审理商品房买卖合同纠纷案件适用法律若干问题的解释》第十四条，如果合同没有约定或约定不明确，可以按照以下原则处理：
面积误差比绝对值在3%以内（含3%），按照合同约定的价款据实结算。
面积误差比绝对值超出3%，买受人请求解除合同、返还已付购房款及利息的，应予支持。
建议
收集证据：在处理层高不够的问题时，应收集相关证据，如房屋买卖合同、验房报告、与开发商的沟通记录等，以便在协商或法律诉讼中提供支持。
咨询专业人士：在处理此类问题时，建议咨询专业律师或法律机构，以获得更准确的法律意见和解决方案。
保留权利：在协商过程中，应保留所有沟通记录和文件，以备不时之需。如果最终需要通过法律途径解决问题，这些文件将是重要的证据。
