深圳车辆违章申诉的程序如下：
车主需要带上身份证、行驶证、驾照等材料。
车主到牌照归属地的车管所车辆科提起行政复议。
被处罚人不服公安交通管理机关的警告、罚款裁决或者公安机关拘留裁决的，可在接到通知后十五日内向主管公安机关或者上一级公安交通管理机关提出申诉。
被处罚人不服公安交通管理机关吊扣驾驶证裁决的，可以在接到裁决书后五日内，向上一级公安交通管理机关或者主管公安机关申请复议一次。
提交行驶证、驾驶证、身份证等资料，并领取违章处罚决定书。
向工作人员提出申诉并填写行政复议申请表。
带上行政复议申请表、处罚决定书、驾驶证、行驶证、身份证等资料到当地的公安部门提交申请。
申诉受理后交管部门会重新对本次违章的违章内容和处罚作出核对，并在七个工作日内给与答复以及相应的措施。
主管公安机关或者上一级公安交通管理机关应当在接到申诉后五日内作出裁决。
如果对于复议以后的结果还是不服，则可以提起诉讼。
对交通管理处罚不服、超过期限提出申诉的，或者事后对当场处罚决定不服提出申诉的，可以作为人民来信来访处理。
申请复议的方式可以是口头申请复议，也可以书面申请复议。口头申请复议由行为人本人到上一级机关的法制部门进行口头陈述并说明不服的原因和理由，同时提供行政处罚决定书。书面申请复议则需要写一个行政复议申请书，载明申请复议的事实、理由和复议要求，递交给法制部门的工作人员。
建议：
在申诉前先将罚款缴清，再去当地的交通支队了解违章详情，比如调看违章时的监控录像，这样有助于申诉的成功。
在填写行政复议申请书时，一定要将违章的来源交待清楚，如果有视频或是第三者的证据更好，然后提交后耐心等待结果。
