处理破坏桃树的问题，可以根据具体情况采取以下措施：
如果桃树是被他人故意毁坏，可以首先尝试与侵权人进行协商，要求其恢复原状或赔偿损失。
如果协商无果，可以依据《侵权责任法》等相关法律法规，向人民法院提起诉讼，要求侵权人承担修复费用、停运损失和精神损害赔偿等。
若涉及刑事责任，根据《治安管理处罚法》和《刑法》，故意毁坏公私财物，数额较大或有其他严重情节的，将面临拘留、罚款甚至刑事处罚。
如果桃树是因为政府行为（如强拆）而被毁坏，可以向政府反映情况，要求合理的补偿和恢复果树所有权。
对于桃树因病虫害或机械损伤导致的烂根，可以采取清除烂根、排水中耕、施生物菌肥等技术手段进行处理，以恢复桃树的生长。
为防止类似事件再次发生，可以考虑加强桃树的维护管理，定期检查病虫害，及时修剪和施肥，提高桃树的抗病虫害能力。
建议根据具体情况选择合适的处理方式，并在必要时寻求专业法律或技术帮助。
