休息时间的工资扣除主要依据《中华人民共和国劳动法》以及《工资支付暂行条例》等相关规定，具体扣除方式如下：
每个工作日的标准工时为8小时，包含一个小时的休息时间。
工作日加班：支付不低于工资的150%的工资报酬。
休息日加班：支付不低于工资的200%的工资报酬，且可以安排补休。
法定休假日加班：支付不低于工资的300%的工资报酬，且不能安排补休。
病假工资的计算基数通常为当地最低工资标准的80%至100%，具体比例依据公司政策而定。
病假一天扣工资数额 = 月薪 ÷ 21.75 × 40%。
事假期间不算出勤，扣除的工资为日平均工资乘以请假天数。
带薪年休假、婚假、产假、陪产假、丧假等，劳动者可以享受带薪休假，用人单位不得扣工资。
建议
加班工资：企业应严格按照法律规定支付加班工资，避免违法行为。
病假工资：企业应制定合理的病假工资政策，确保员工病假期间的基本生活。
事假工资：企业应明确事假工资的扣除标准，并与员工进行充分沟通。
带薪休假：企业应尊重并保障员工的带薪休假权益。
这些规定旨在保护劳动者的合法权益，确保企业在休息时间的工资扣除合理合法。企业应严格遵守相关法律规定，以维护良好的劳动关系。
